科技日报记者 马爱平 通讯员 金云翔 艾超
近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究优化策略。相关成果发表在《土壤生物学与生物化学》(Soil Biology & Biochemistry)上。
相对定量(RMP)和绝对定量(AMP)方法对微生物群落结构分析的差异 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所供图
微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中发挥关键作用。随着高通量测序等技术的革命性突破,极大地增加了我们对微生物多样性、群落结构和物种组成的认识。然而,测序数据仅提供微生物群落的相对丰度变化,忽略了微生物绝对数量的变化规律。针对高通量测序数据的这一缺陷,研究人员已经开发出多种微生物绝对丰度定量方法,例如,内参法(spike-AMP)、 荧光定量法与高通量测序结合(qPCR-AMP)、 流式细胞仪与高通量测序结合(FCM-AMP)等。然而,这些定量方法的普遍适用性和精确度尚不清楚。
研究团队利用采自黑龙江海伦和海南三亚的两类差异较大的土壤样品,评估了土壤微生物研究中最常用的两种绝对定量方法内参法和荧光定量法与高通量测序结合的方法。结果表明:内参法在准确性、稳定性和工作量等方面没有显示出任何优势。相比之下,更常用的荧光定量法与高通量测序结合的方法对探究环境扰动对土壤微生物动力学的影响提供了有价值的见解。考虑其稳定性和技术可行性,荧光定量法与高通量测序结合方法可广泛应用于土壤微生物群落的定量研究。
该研究得到国家自然科学基金、中国科协青年托举计划等项目资助。
近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究优化策略。...
3月8日上午,天津医科大学总医院妇产科HPV疫苗及宫颈病变一体化诊治门诊开诊揭牌。HPV是人体乳头瘤病毒...
轻点手机就能快速查询重要文件,有网络就能随时查看自己的家庭档案……3月8日,由北京市妇联、北京市档...
从九宫格直播画面可以清晰地看到,其中一辆无人车正在通过亦庄交通环境最为复杂,人流量、车流量密度最...
“奶油,带妈妈去洗手间。”一位视障女士话音未落,一只可爱的金毛导盲犬摇着尾巴,欣然走到前面导引带...