科技日报记者 张梦然
根据发表在《美国国家科学院院刊》上的一项研究，美国西北大学医学研究人员使用独特的高通量方法，解决了具有挑战性的蛋白质设计难题。这种方法可促进新疗法和生物技术工具的开发。
(资料图)
图片来源：物理学家组织网
研究的资深作者、西北大学药理学助理教授加布里尔·罗克林博士称，设计ɑββɑ蛋白质的经验教训对于任何计算蛋白质设计工作都很重要，包括设计新的治疗方法。
蛋白质折叠是一种重要的细胞过程，使蛋白质能够正常运作并避免导致疾病。在实验室中计算设计新蛋白质结构的一个主要挑战是，大多数设计的蛋白质在测试时都无法折叠成其设计的结构。
在之前的工作中，罗克林团队发现ɑββɑ折叠尽管结构简单，但设计起来异常具有挑战性，最好的设计只有2%的成功率。为了解决这个问题，研究团队测试了数千种新的ɑββɑ设计，并使用机器学习来检查稳定和不稳定设计的属性。
罗克林表示，ɑββɑ蛋白质有一个非常简单的折叠，看起来像字母“M”。这种结构比大多数天然存在的蛋白质简单得多，这使其成为理解和改进蛋白质设计的良好试验物。
在新研究中，研究人员设计了超过10000种新的ɑββɑ蛋白，并通过专门的高通量实验发现其中超过1/3折叠成稳定的结构。研究人员还能够确定稳定ɑββɑ蛋白质的生物物理特性，比较不同的蛋白质设计方法。
罗克林称：“通过更改我们的设计协议，我们将设计成功率从2%提高到30%以上。这阐明了设计ɑββɑ蛋白质的更好方法，也帮助我们了解是什么使它们更稳定或更不稳定。”
目前的方法适用于任何计算蛋白质设计工作。此外，ɑββɑ蛋白也有可能通过修饰其表面而发展成治疗药物，以便它们可与治疗靶点结合。
研究人员表示，通过将“M”的两端连接在一起形成一个环，这些蛋白质可变得更加稳定，这可能是设计新疗法的一个令人兴奋的策略。
标签： 结构设计
根据发表在《美国国家科学院院刊》上的一项研究，美国西北大学医学研究人员使用独特的高通量方法，解决...
英国《自然》杂志在10月28日的报道中指出，中国的天宫空间站即将建成，未来十年，科学家们将在“天宫”...
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目，在这些位点中，RNA在整个人类生命周期中...
据杜克—新加坡国立大学医学院科学家领导的一项新研究，新冠mRNA疫苗和灭活疫苗诱导的T细胞反应的总规模...
10月31日，东南亚旗舰电商平台Lazada发布公司史上首份ESG报告——《塑造数字经济的未来》。报告显示，成...
北汽蓝谷发布三季报 极狐发力高端市场
皓丽2022线上发布会：5大新品亮相，多位行业大咖与合作伙伴助阵！
今日快看!颜宁宣布离美归国 
